Lo primero que se debe destacar antes de entrar en los métodos de torturas son los llamados Autos de Fe, que fueron una manifestación pública de la Inquisición. Si la sentencia de la Inquisición era condenatoria, implicaba que el condenado debía participar en la ceremonia así llamada, que solemnizaba su retorno al seno de la Iglesia (en la mayor parte de los casos o su castigo como hereje impenitente. Los autos de fe podían ser privados ("auto particuguir lar") o públicos ("auto público" o "auto general"
Por otro lado, los métodos de torturas dependia del criterio exclusivo del Inquisidor, y según él, la tortura canalizaba el pecado. Los métodos mas sueves son por ejemplo método del agua que consistía en sumergir a las personas en barriles de agua. A medida que se fue extendiendo el poder de la Inquisiciòn las torturas fueron mas fuertes son:
Por otro lado, los métodos de torturas dependia del criterio exclusivo del Inquisidor, y según él, la tortura canalizaba el pecado. Los métodos mas sueves son por ejemplo método del agua que consistía en sumergir a las personas en barriles de agua. A medida que se fue extendiendo el poder de la Inquisiciòn las torturas fueron mas fuertes son:
Doncella de Hierro: consistía en una estructura de hierro con algunos clavos que tenía la figura de una mujer donde los reo o condenados eran encerrados por el tiempo que terminara el inquisidor.
La Cuna de Judas: consistía en atar a la víctima de las muñecas y elevarla, para luego dejarla caer sobre una pirámide muy puntiaguda para que con su propio peso se le clavara en el ano, escroto o vagina. Ni que decir tiene, que la confesión se conseguía en las primeras veces, ya que esta operación se repetía sucesivamente hasta que el condenado hablara o muriera, caso este último, que confirmaba su culpabilidad.
Aplasta craneos: consistía en una estructura de metal de fuerza graduable, es decir, que podía aprendar más y más. Dicha estructura estaba diseñada para el craneo, el cual era introducido y apretado dependiendo de daño que queria hacer el inquisidor. 
Pera: era un instrumento realizado con metal y era forzadaen la boca, recto o vagina de la víctima y allí expandidos a fuerza por el tornillo a su máxima apertura. El interior de la cavidad en cuestión era irremediablemente mutilada, y casi siempre fatalmente. Las puntas al final de los segmentos servían para cortar mejor la garganta, los intestinos y el cervix. El uso de la pera originalmente fue ideado para aquellas mujeres que habían sido encontradas culpables de la unión sexual con el diablo o sus familiares.
El potro: es un instrumento de tortura en el que la víctima, atada de pies y manos con unas cuerdas o cintas de cuero, a los dos extremos de este aparato, era estirada lentamente produciéndole la luxación de todas las articulaciones -muñecas, tobillos, codos, rodillas, hombros y caderas-. Este método, se tiene constancia que se aplicó durante todo el período que duró la Inquisición en los países de Francia y Alemania; si bien ya se conocía desde mucho antes y por supuesto se utilizaba frecuentemente en las lúgubres mazmorras de castillos, prisiones y palacios de justicia.Finalmente muchos fueron los instrumentos de torturas ideados por la Inquisición, para purificar el alma, segñun ellos, faltarían muchos métodos de torturas, pero aqui estan los principales, cada Estado donde tenía dominio la inquisición tenían sus propias prácticas de torturas. A continuación podran observar un fragmento de la película Los Fantamas de Goyas, que muestran como eran los juicios del Santo Oficio en España
